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Enregistrement W2098140813 · doi:10.1128/aac.00021-10

Homozygous Triplicate Mutations in Three 16S rRNA Genes Responsible for High-Level Aminoglycoside Resistance in<i>Nocardia farcinica</i>Clinical Isolates from a Canada-Wide Bovine Mastitis Epizootic

2010· article· en· W2098140813 sur OpenAlexaboutno aff
Takahisa Kogure, Reona Shimada, Jun Ishikawa, Katsukiyo Yazawa, June M. Brown, Yuzuru Mikami, Tohru Gonoi

Notice bibliographique

RevueAntimicrobial Agents and Chemotherapy · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueParasitic Infections and Diagnostics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCenters for Disease Control and Prevention
Mots-clés16S ribosomal RNAEpizooticMastitisBiologyMicrobiologyAminoglycosideNocardiaGeneVirologyGeneticsAntibioticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nocardia farcinica strains showing high-level resistance to amikacin were isolated from clinical cases in a Canada-wide bovine mastitis epizootic. Shotgun cloning of the resistance genes in the amikacin-resistant mastitis isolate N. farcinica IFM 10580 (W6220 [Centers for Disease Control and Prevention]) using a multicopy vector system revealed that the 16S rRNA gene with an A-to-G single-point mutation at position 1408 (in Escherichia coli numbering) conferred "moderate" cross-resistance to amikacin and other aminoglycosides to an originally susceptible N. farcinica strain IFM 10152. Subsequent DNA sequence analyses revealed that, in contrast to the susceptible strain, all three chromosomal 16S rRNA genes of IFM 10580, the epizootic clinical strain, contained the same A1408G point mutations. Mutant colonies showing high-level aminoglycoside resistance were obtained when the susceptible strain N. farcinica IFM 10152 was transformed with a multicopy plasmid carrying the A1408G mutant 16S rRNA gene and was cultured in the presence of aminoglycosides for 3 to 5 days. Of these transformants, at least two of the three chromosomal 16S rRNA genes contained A1408G mutations. A triple mutant was easily obtained from a strain carrying the two chromosomal A1408G mutant genes and one wild-type gene, even in the absence of the plasmid. The triple mutant showed the highest level of resistance to aminoglycosides, even in the absence of the plasmid carrying the mutant 16S rRNA gene. These results suggest that the homozygous mutations in the three 16S rRNA genes are responsible for the high-level aminoglycoside resistance found in N. farcinica isolates of the bovine mastitis epizootic.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,617
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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