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Enregistrement W2098245314 · doi:10.1128/mcb.01641-07

DOG-1 Is the <i>Caenorhabditis elegans</i> BRIP1/FANCJ Homologue and Functions in Interstrand Cross-Link Repair

2007· article· en· W2098245314 sur OpenAlexafffund
Jillian L. Youds, Louise J. Barber, Jordan D. Ward, Spencer J. Collis, Nigel J. O’Neil, Simon J. Boulton, Ann M. Rose

Notice bibliographique

RevueMolecular and Cellular Biology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCancer Research UKNational Institutes of HealthMichael Smith Health Research BCCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFanconi Anemia Research Fund
Mots-clésBiologyCaenorhabditis elegansDNA repairGeneticsFanconi anemiaDNA replicationMutantDNA damageMutationFANCD2Molecular biologyGenetic screenDNACell biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fanconi anemia (FA) is a cancer susceptibility syndrome characterized by defective DNA interstrand cross-link (ICL) repair. Here, we show that DOG-1 is the Caenorhabditis elegans homologue of FANCJ, a helicase mutated in FA-J patients. DOG-1 performs a conserved role in ICL repair, as dog-1 mutants are hypersensitive to ICL-inducing agents, but not to UVC irradiation or X rays. Genetic analysis indicated that dog-1 is epistatic with fcd-2 (C. elegans FANCD2) but is nonepistatic with brc-1 (C. elegans BRCA1), thus establishing the existence of two distinct pathways of ICL repair in worms. Furthermore, DOG-1 is dispensable for FCD-2 and RAD-51 focus formation, suggesting that DOG-1 operates downstream of FCD-2 and RAD-51 in ICL repair. DOG-1 was previously implicated in poly(G)/poly(C) (G/C) tract maintenance during DNA replication. G/C tracts remain stable in the absence of ATL-1, CLK-2 (FA pathway activators), FCD-2, BRC-2, and MLH-1 (associated FA components), implying that DOG-1 is the sole FA component required for G/C tract maintenance in a wild-type background. However, FCD-2 is required to promote deletion-free repair at G/C tracts in dog-1 mutants, consistent with a role for FA factors at the replication fork. The functional conservation between DOG-1 and FANCJ suggests a possible role for FANCJ in G/C tract maintenance in human cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations102
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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