Analysis of long-lived <i>C. elegans daf-2</i> mutants using serial analysis of gene expression
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Notice bibliographique
Résumé
We have identified longevity-associated genes in a long-lived Caenorhabditis elegans daf-2 (insulin/IGF receptor) mutant using serial analysis of gene expression (SAGE), a method that efficiently quantifies large numbers of mRNA transcripts by sequencing short tags. Reduction of daf-2 signaling in these mutant worms leads to a doubling in mean lifespan. We prepared C. elegans SAGE libraries from 1, 6, and 10-d-old adult daf-2 and from 1 and 6-d-old control adults. Differences in gene expression between daf-2 libraries representing different ages and between daf-2 versus control libraries identified not only single genes, but whole gene families that were differentially regulated. These gene families are part of major metabolic pathways including lipid, protein, and energy metabolism, stress response, and cell structure. Similar expression patterns of closely related family members emphasize the importance of these genes in aging-related processes. Global analysis of metabolism-associated genes showed hypometabolic features in mid-life daf-2 mutants that diminish with advanced age. Comparison of our results to recent microarray studies highlights sets of overlapping genes that are highly conserved throughout evolution and thus represent strong candidate genes that control aging and longevity.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle