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Enregistrement W2098388104 · doi:10.1128/jcm.38.2.630-634.2000

PCR-Based Assay To Quantify Human Immunodeficiency Virus Type 1 DNA in Peripheral Blood Mononuclear Cells

2000· article· en· W2098388104 sur OpenAlexaff
Cindy Christopherson, Yorda Kidane, Brian Conway, John F. Krowka, Haynes W. Sheppard, Shirley Kwok

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious Diseases
Mots-clésPeripheral blood mononuclear cellDNAVirologyBiologyReal-time polymerase chain reactionPolymerase chain reactionVirusgenomic DNALentivirusMolecular biologyViral loadViral diseaseImmunologyGeneIn vitroGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An assay that quantifies the amount of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) DNA in peripheral blood mononuclear cells has been developed. PCR amplification of the HIV-1 DNA is performed in the presence of an internal quantitation standard, and colorimetric detection of the amplified product is performed with microwell plates. The copies of HIV-1 DNA are normalized to total genomic DNA input. The assay has an analytical sensitivity of 10 input copies per amplification reaction and a three-log detection range. In an analysis of sequential samples from patients on combination therapy, HIV-1 DNA was quantifiable for all individuals tested, including those with undetectable plasma HIV-1 RNA. In a separate study, a comparison of HIV-1 DNA levels was made with a group of long-term survivors and progressors. The mean HIV-1 DNA levels were lower in the long-term survivors than in the progressors (P, 0.04). The mean HIV-1 RNA levels were also lower, but the difference was not statistically significant (P, 0.164). A quantitative DNA assay will provide an additional tool to gain insight into the natural history of infection and the continued efficacy of potent antiretroviral therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,693
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations99
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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