PCR-Based Assay To Quantify Human Immunodeficiency Virus Type 1 DNA in Peripheral Blood Mononuclear Cells
Notice bibliographique
Résumé
An assay that quantifies the amount of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) DNA in peripheral blood mononuclear cells has been developed. PCR amplification of the HIV-1 DNA is performed in the presence of an internal quantitation standard, and colorimetric detection of the amplified product is performed with microwell plates. The copies of HIV-1 DNA are normalized to total genomic DNA input. The assay has an analytical sensitivity of 10 input copies per amplification reaction and a three-log detection range. In an analysis of sequential samples from patients on combination therapy, HIV-1 DNA was quantifiable for all individuals tested, including those with undetectable plasma HIV-1 RNA. In a separate study, a comparison of HIV-1 DNA levels was made with a group of long-term survivors and progressors. The mean HIV-1 DNA levels were lower in the long-term survivors than in the progressors (P, 0.04). The mean HIV-1 RNA levels were also lower, but the difference was not statistically significant (P, 0.164). A quantitative DNA assay will provide an additional tool to gain insight into the natural history of infection and the continued efficacy of potent antiretroviral therapies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,007 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».