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Enregistrement W2098395872 · doi:10.3389/fgene.2014.00020

Assessing the quality of studies supporting genetic susceptibility and outcomes of ARDS

2014· article· en· W2098395872 sur OpenAlexaff
Marialbert Acosta‐Herrera, Maria Pino‐Yanes, Lina Pérez‐Méndez, Jesús Villar, Carlos Flores

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Genetics · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSepsis Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesInstituto de Salud Carlos IIIEuropean CommissionFundación Ramón Areces
Mots-clésARDSMedicinePopulation stratificationGenetic associationIntensive care medicinePopulationAcute respiratory distressDiseaseGenetic predispositionBiologyEnvironmental healthGeneticsInternal medicineGeneLungGenotypeSingle-nucleotide polymorphism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The acute respiratory distress syndrome (ARDS) is a severe inflammatory disease manifested as a result of pulmonary and systemic responses to several insults. It is now well accepted that genetic variation influences these responses. However, little is known about the genes that are responsible for patient susceptibility and outcome of ARDS. Methodological flaws are still abundant among genetic association studies with ARDS and here, we aimed to highlight the quality criteria where the standards have not been reached, to expose the associated genes to facilitate replication attempts, and to provide quick-reference guidance for future studies. We conducted a PubMed search from January 2008 to September 2012 for original articles. Studies were considered if a statistically significant association was declared with either susceptibility or outcomes of all-cause ARDS. Fourteen criteria were used for evaluation and results were compared to those from a previous quality assessment report. Significant improvements affecting study design and statistical analysis were detected. However, major issues such as adjustments for the underlying population stratification and replication studies remain poorly addressed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,475
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,747
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,525
Score d'incertitude au seuil0,647

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,4750,747
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0090,014
Bibliométrie0,0280,025
Études des sciences et des technologies0,0020,006
Communication savante0,0090,006
Science ouverte0,0050,005
Intégrité de la recherche0,0040,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,135
Tête enseignante GPT0,454
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeRevue systématique
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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