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Enregistrement W2098428537 · doi:10.1111/j.1462-2920.2012.02890.x

<scp> <scp>Wzx</scp> </scp> flippase‐mediated membrane translocation of sugar polymer precursors in bacteria

2012· review· en· W2098428537 sur OpenAlexafffund
Salim T. Islam, Joseph S. Lam

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Microbiology · 2012
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Research ChairsCystic Fibrosis Canada
Mots-clésPeriplasmic spaceAntiporterBiologyInner membraneBiochemistryBiophysicsCell biologyMembraneGeneEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bacterial cell surface polysaccharides confer resistance to external stress and promote survival in biotic and abiotic environments. Glycan assembly often occurs at the periplasmic leaflet of the inner membrane (IM) from undecaprenyl pyrophosphate (UndPP)-linked polysaccharide units via the Wzx/Wzy-dependent pathway. Wzx is an integral IM protein found in Gram-negative and Gram-positive bacteria that mediates IM translocation of UndPP-linked sugar repeats from the cytoplasmic to the periplasmic leaflet; interaction of Wzx with other assembly proteins is indirectly supported by genetic evidence. Topological mapping has indicated 12 α-helical transmembrane segments (TMS), with the number of charged TMS residues fluctuating based on the mapping method used. A novel Wzx tertiary structure model has been built, allowing for substrate-binding or energy-coupling roles to be proposed for functionally important charged and aromatic TMS residues. It has also led to a proposed antiport-like mechanism of Wzx function. Exquisite substrate specificity of Wzx proteins was recently revealed in distinguishing between UndPP-linked substrates with identical main-chain sugar repeats, but differing in the chemical composition of a terminal sugar side-branch cap. The objective of this review is to synthesize the most up-to-date knowledge concerning Wzx flippases and to provide perspective for future investigations in this burgeoning field.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,678
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0030,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations107
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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