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Enregistrement W2098446935 · doi:10.1128/iai.00018-13

Congenic Strains for Genetic Analysis of Virulence Traits in Cryptococcus gattii

2013· article· en· W2098446935 sur OpenAlexaboutno aff
Pinkuan Zhu, Bing Zhai, Xiaorong Lin, Alexander Idnurm

Notice bibliographique

RevueInfection and Immunity · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Infections and Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthChina Scholarship Council
Mots-clésBiologyCryptococcus gattiiVirulenceCongenicCryptococcusMicrobiologyGeneticsCryptococcosisVirologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cryptococcus gattii is responsible for a large outbreak of potentially fatal disease that started in the late 1990s on Vancouver Island, Canada. How this fungus and the outbreak isolates in particular cause disease in immunocompetent people is unknown, with differing hypotheses. To explore genetic contributions, a pair of congenic a and α mating type strains was generated by a series of 11 backcrosses to introgress the MAT locus from a nonoutbreak strain into the background of strain R265, isolated from a Vancouver Island patient. The congenic pair was used to investigate three traits: mitochondrial inheritance, the effect of the MAT alleles on virulence, and the impact of a predicted virulence factor on pathogenicity. The two congenic strains show the same virulence in different models of cryptococcosis and equivalent levels of competition in coinfection assays. These results rule out a role of the MAT locus and mitochondrial genotype as major virulence factors in the outbreak strains. Disruption of Bwc2, a light-dependent transcription factor, resulted in reduced virulence, consistent with a similar function in the related species Cryptococcus neoformans. The C. gattii congenic strains represent a new resource for exploring the evolution of virulence in the C. neoformans-C. gattii clade.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,098
Score d'incertitude au seuil0,408

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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