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Enregistrement W2098512467 · doi:10.1093/protein/gzi055

N-Glycosidase–carbohydrate-binding module fusion proteins as immobilized enzymes for protein deglycosylation

2005· article· en· W2098512467 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueProtein Engineering Design and Selection · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme Production and Characterization
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaHeritage Medical Research Clinic
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlycanChemistryCarbohydrate-binding moduleGlycoside hydrolaseBiochemistryGlycoproteinThermostabilityAffinity chromatographyFusion proteinEnzymeEscherichia coliChromatographyRecombinant DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A carbohydrate-binding module (CBM) was fused to the N-termini of mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase (EndoF1) and peptide N-glycosidase F (PNGaseF), two glycosidases from Chryseobacterium meningosepticum that are used to remove N-linked glycans from glycoproteins. The fusion proteins CBM-EndoF1 and CBM-PNGaseF also carry a hexahistidine tag for purification by immobilized metal affinity chromatography after production by Escherichia coli. CBM-EndoF1 is as effective as native EndoF1 at deglycosylating RNaseB; the glycans released by both enzymes are identical. Like native PNGaseF, CBM-PNGaseF is active on denatured but not on native RNaseB. Both fusion proteins are as active on RNaseB when immobilized on cellulose as they are in solution. They retain activity in the immobilized state for at least 1 month at 4 degrees C. The hexahistidine tag can be removed with thrombin, leaving the CBM as the only affinity tag. The CBM can be removed with factor Xa if required.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,385
Score d'incertitude au seuil0,889

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle