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Enregistrement W2098549986 · doi:10.1039/c3nr03547f

Architecture based on the integration of intermolecular G-quadruplex structure with sticky-end pairing and colorimetric detection of DNA hybridization

2013· article· en· W2098549986 sur OpenAlexaff
Hongbo Li, Zai‐Sheng Wu, Zhifa Shen, Guo‐Li Shen, Ru‐Qin Yu

Notice bibliographique

RevueNanoscale · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésIntermolecular forcePairingDNAIntercalation (chemistry)OligonucleotideConcatemerBase pairNanochemistryNanotechnologyDNA nanotechnologyG-quadruplexChemistryBiophysicsMaterials scienceBiologyPhysicsMoleculeBiochemistryGeneGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An interesting discovery is reported in that G-rich hairpin-based recognition probes can self-assemble into a nano-architecture based on the integration of an intermolecular G-quadruplex structure with the sticky-end pairing effect in the presence of target DNAs. Moreover, GNPs modified with partly complementary DNAs can intensively aggregate by hybridization-based intercalation between intermolecular G-quadruplexes, indicating an inspiring assembly mechanism and a powerful colorimetric DNA detection. The proposed intermolecular G-quadruplex-integrated sticky-end pairing assembly (called GISA)-based colorimetric system allows a specific and quantitative assay of p53 DNA with a linear range of more than two orders of magnitude and a detection limit of 0.2 nM, suggesting a considerably improved analytical performance. And more to the point, the discrimination of single-base mismatched target DNAs can be easily conducted via visual observation. The successful development of the present colorimetric system, especially the GISA-based aggregation mechanism of GNPs is different from traditional approaches, and offers a critical insight into the dependence of the GNP aggregation on the structural properties of oligonucleotides, opening a good way to design colorimetric sensing probes and DNA nanostructure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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