In Vivo Evidence for TonB Dimerization
Notice bibliographique
Résumé
TonB, in complex with ExbB and ExbD, is required for the energy-dependent transport of ferric siderophores across the outer membrane of Escherichia coli, the killing of cells by group B colicins, and infection by phages T1 and phi80. To gain insights into the protein complex, TonB dimerization was studied by constructing hybrid proteins from complete TonB (containing amino acids 1 to 239) [TonB(1-239)] and the cytoplasmic fragment of ToxR which, when dimerized, activates the transcription of the cholera toxin gene ctx. ToxR(1-182)-TonB(1-239) activated the transcription of lacZ under the control of the ctx promoter (P(ctx)::lacZ). Replacement of the TonB transmembrane region by the ToxR transmembrane region resulted in the hybrid proteins ToxR(1-210)-TonB(33-239) and ToxR(1-210)-TonB(164-239), of which only the latter activated P(ctx)::lacZ transcription. Dimer formation was reduced but not abolished in a mutant lacking ExbB and ExbD, suggesting that these complex components may influence dimerization but are not strictly required and that the N-terminal cytoplasmic membrane anchor and the C-terminal region are important for dimer formation. The periplasmic TonB fragment, TonB(33-239), inhibits ferrichrome and ferric citrate transport and induction of the ferric citrate transport system. This competition provided a means to positively screen for TonB(33-239) mutants which displayed no inhibition. Single point mutations of inactive fragments selected in this manner were introduced into complete TonB, and the phenotypes of the TonB mutant strains were determined. The mutations located in the C-terminal half of TonB, three of which (Y163C, V188E, and R204C) were obtained separately by site-directed mutagenesis, as was the isolated F230V mutation, were studied in more detail. They displayed different activity levels for various TonB-dependent functions, suggesting function-related specificities which reflect differences in the interactions of TonB with various transporters and receptors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».