A Novel Karyopherin-β Homolog Is Developmentally and Hormonally Regulated in Fetal Lung
Notice bibliographique
Résumé
To investigate molecular mechanisms of lung organogenesis, we used representational difference analysis to search for glucocorticoid-inducible genes in developing lung in a fetal rat model. Messenger RNA prepared from fetal and adult rat lung was used to prepare "representative amplicons." Adult-lung complementary DNA (cDNA) amplicons were used as "driver" in successive rounds of subtractive hybridization/amplification to isolate target fetal lung-specific cDNAs. A single clone, which was conserved and had near-perfect homology to eight human/rodent expressed sequence tags, was used as template for 5' and 3' rapid amplification of cDNA ends and SPICE (system for polymerase chain reaction amplification of cDNA ends) reactions to obtain the 3.6-kb cDNA, LGL2 (Genbank, AF 110195) encoding a deduced polypeptide (lgl2) of 963 amino acids. Northern analysis confirmed that LGL2 is differentially expressed in fetal lung (maximal during the pseudoglandular stage, gestational Days 14 to 16), induced by glucocorticoid, and enriched in epithelium relative to the mesenchyme. LGL2 was also detected in human fetal lung at gestational Week 16 as well as in human and rat fetal brain, heart, intestine, and kidney. We mapped LGL2 to chromosome 1p33-34.2. Comparison with sequences in the genome database identified lgl2 as a member of the karyopherin-beta family of nuclear import proteins, with greatest homology to transportin SR. Maximal expression of LGL2 in the pseudoglandular stage of development is coordinate with that of key transcription factors that regulate prominent signal transduction pathways in fetal lung organogenesis. We propose a role for lgl2 in nuclear import of transcription factors that regulate signal transduction during fetal lung development.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».