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Enregistrement W2098848720 · doi:10.1099/vir.0.80624-0

Mitogen-induced upregulation of hepatitis C virus expression in human lymphoid cells

2005· article· en· W2098848720 sur OpenAlexaff
Tram N. Q. Pham, Sonya A. MacParland, Carla S. Coffin, Samuel S. Lee, Ford Bursey, Tomasz I. Michalak

Notice bibliographique

RevueJournal of General Virology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis C virus research
Établissements canadiensUniversity of CalgaryHealth Sciences CentreMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHepatitis C virusPeripheral blood mononuclear cellBiologyVirologyFlow cytometryNS3Ex vivoVirusHepacivirusImmunologyHepatitis CMolecular biologyIn vivoIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Considering growing evidence indicating that hepatitis C virus (HCV) replicates in lymphoid cells, establishment of a reliable and sensitive method for detection of HCV in these cells may provide means for monitoring the infection and the efficacy of sterilizing antiviral therapy. In this study, conditions for ex vivo augmentation and detection of the HCV genome in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from patients with chronic hepatitis C (CHC) or after a sustained virological response (SVR) to antiviral treatment were assessed. Following stimulation with combinations of mitogens and/or cytokines, PBMCs and, in certain cases, affinity-purified T and B cells were examined for HCV positive- and negative-strand RNA by using RT-PCR followed by nucleic acid hybridization, while the presence of viral NS3 protein was determined by flow cytometry. HCV RNA augmentation was assessed by quantification of Southern and dot-blot hybridization signals. The results showed that treatment of peripheral lymphoid cells with mitogens stimulating T- and B-cell proliferation and with cytokines supporting their growth significantly increased HCV RNA detection in patients with both CHC and SVR. This enhancement was up to 100-fold for the HCV genome and fivefold for the NS3 protein compared with untreated cells. In conclusion, HCV RNA can be readily detected in circulating lymphoid cells in progressing hepatitis C and following SVR after ex vivo cell stimulation. As such, this method offers a new investigative tool to study HCV lymphotropism and to monitor virus presence during the course of HCV infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,333
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations62
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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