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Enregistrement W2098861121 · doi:10.1091/mbc.e05-07-0617

The<i>Aspergillus fumigatus</i>StuA Protein Governs the Up-Regulation of a Discrete Transcriptional Program during the Acquisition of Developmental Competence

2005· article· en· W2098861121 sur OpenAlexafffund
Donald C. Sheppard, Thomas Doedt, Lisa Y. Chiang, Sun Kim, Dan Chen, William C. Nierman, Scott G. Filler

Notice bibliographique

RevueMolecular Biology of the Cell · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchBurroughs Wellcome Fund
Mots-clésBiologyCompetence (human resources)Aspergillus fumigatusTranscriptional regulationFungal proteinCell biologyGeneticsComputational biologyTranscription factorMicrobiologyGeneSaccharomyces cerevisiae

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Members of the Asm1p, Phd1p, Sok2p, Efg1p, and StuAp (APSES) family of fungal proteins regulate morphogenesis and virulence in ascomycetes. We cloned the Aspergillus fumigatus APSES gene encoding StuAp and demonstrated that stuA transcription is markedly up-regulated after the acquisition of developmental competence. A. fumigatus DeltastuA mutants were impaired in their ability to undergo asexual reproduction. Conidiophore morphology was markedly abnormal, and only small numbers of dysmorphic conidia were produced, which exhibited precocious germination. Whole genome transcriptional analysis during the onset of developmental competence was performed and identified a subset of developmentally regulated genes that were stuA dependent, including a cluster of putative secondary metabolite biosynthesis genes, genes encoding proteins implicated in the regulation of morphogenesis, and genes encoding allergens and other antigenic proteins. Additionally, hyphae of the DeltastuA mutant displayed reduced expression of the catalase gene CAT1 and were hypersusceptible to hydrogen peroxide.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,236
Score d'incertitude au seuil0,325

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations132
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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