p110 CUX1 Cooperates with E2F Transcription Factors in the Transcriptional Activation of Cell Cycle-Regulated Genes
Notice bibliographique
Résumé
The transcription factor p110 CUX1 was shown to stimulate cell proliferation by accelerating entry into S phase. As p110 CUX1 can function as a transcriptional repressor or activator depending on promoter context, we investigated its mechanism of transcriptional activation using the DNA polymerase alpha gene promoter as a model system. Linker-scanning analysis revealed that a low-affinity E2F binding site is required for transcriptional activation. Moreover, coexpression with a dominant-negative mutant of DP-1 suggested that endogenous E2F factors are indeed needed for p110-mediated activation. Tandem affinity purification, coimmunoprecipitation, chromatin immunoprecipitation, and reporter assays indicated that p110 CUX1 can engage in weak protein-protein interactions with E2F1 and E2F2, stimulate their recruitment to the DNA polymerase alpha gene promoter, and cooperate with these factors in transcriptional activation. On the other hand, in vitro assays suggested that the interaction between CUX1 and E2F1 either is not direct or is regulated by posttranslational modifications. Genome-wide location analysis revealed that targets common to p110 CUX1 and E2F1 included many genes involved in cell cycle, DNA replication, and DNA repair. Comparison of the degree of enrichment for various E2F factors suggested that binding of p110 CUX1 to a promoter will favor the specific recruitment of E2F1, and to a lesser extent E2F2, over E2F3 and E2F4. Reporter assays on a subset of common targets confirmed that p110 CUX1 and E2F1 cooperate in their transcriptional activation. Overall, our results show that p110 CUX1 and E2F1 cooperate in the regulation of many cell cycle genes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».