Multivariate Phenotypic Divergence Due to the Fixation of Beneficial Mutations in Experimentally Evolved Lineages of a Filamentous Fungus
Notice bibliographique
Résumé
The potential for evolutionary change is limited by the availability of genetic variation. Mutations are the ultimate source of new alleles, yet there have been few experimental investigations of the role of novel mutations in multivariate phenotypic evolution. Here, we evaluated the degree of multivariate phenotypic divergence observed in a long-term evolution experiment whereby replicate lineages of the filamentous fungus Aspergillus nidulans were derived from a single genotype and allowed to fix novel (beneficial) mutations while maintained at two different population sizes. We asked three fundamental questions regarding phenotypic divergence following approximately 800 generations of adaptation: (1) whether divergence was limited by mutational supply, (2) whether divergence proceeded in relatively many (few) multivariate directions, and (3) to what degree phenotypic divergence scaled with changes in fitness (i.e. adaptation). We found no evidence that mutational supply limited phenotypic divergence. Divergence also occurred in all possible phenotypic directions, implying that pleiotropy was either weak or sufficiently variable among new mutations so as not to constrain the direction of multivariate evolution. The degree of total phenotypic divergence from the common ancestor was positively correlated with the extent of adaptation. These results are discussed in the context of the evolution of complex phenotypes through the input of adaptive mutations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».