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Enregistrement W2099095285 · doi:10.1002/pro.477

Structure of the micronemal protein 2 A/I domain from <i>Toxoplasma gondii</i>

2010· article· en· W2099095285 sur OpenAlex
Michelle L. Tonkin, Ognjen Grujic, Mark Pearce, Joanna Crawford, Martin J. Boulanger

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueProtein Science · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueToxoplasma gondii Research Studies
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésToxoplasma gondiiBiologyProtein structureTransmembrane proteinTransmembrane domainCell biologyOrganellePlasmodium falciparumIntracellular parasiteGeneticsIntracellularBiochemistryGeneMalariaReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Toxoplasma gondii is a widespread zoonotic pathogen capable of causing serious disease in humans and animals. As an obligate intracellular parasite, T. gondii relies on the orchestrated secretion of proteins from its apical complex organelles including the multimodular, transmembrane micronemal protein 2 (MIC2) that couples recognition of the host cell with cytoskeletal reorganization of the parasite to drive invasion. To probe the basis by which the von Willebrand Factor A (vWA)-Integrin like module of TgMIC2 engages the host cell, we solved the crystal structure of a truncated form of TgMIC2A/I (TgMIC2A/Ic) phased by iodide SIRAS and refined to a resolution of 2.05 Å. The TgMIC2A/Ic core is organized into a central twisted beta sheet flanked by α-helices consistent with a canonical vWA fold. A restricted basic patch serves as the putative heparin binding site, but no heparin binding was detected in native gel shift assays. Furthermore, no metal was observed in the metal ion dependent adhesion site (MIDAS). Structural overlays with homologous A/I domains reveal a divergent organization of the MIDAS β4-α4 loop in TgMIC2A/Ic, which is stabilized through the burial of Phe195 into a deep pocket formed by Gly185. Intriguingly, Gly185 appears to be unique among A/I domains to TgMIC2A/I suggesting that the divergent loop conformation may also be unique to TgMIC2A/I. Although lacking the C-terminal extension, the TgMIC2A/Ic structure reported here is the first of an A/I domain from an apicomplexan parasite and provides valuable insight into defining the molecular recognition of host cells by these widespread pathogens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,005
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle