Structure of the micronemal protein 2 A/I domain from <i>Toxoplasma gondii</i>
Notice bibliographique
Résumé
Toxoplasma gondii is a widespread zoonotic pathogen capable of causing serious disease in humans and animals. As an obligate intracellular parasite, T. gondii relies on the orchestrated secretion of proteins from its apical complex organelles including the multimodular, transmembrane micronemal protein 2 (MIC2) that couples recognition of the host cell with cytoskeletal reorganization of the parasite to drive invasion. To probe the basis by which the von Willebrand Factor A (vWA)-Integrin like module of TgMIC2 engages the host cell, we solved the crystal structure of a truncated form of TgMIC2A/I (TgMIC2A/Ic) phased by iodide SIRAS and refined to a resolution of 2.05 Å. The TgMIC2A/Ic core is organized into a central twisted beta sheet flanked by α-helices consistent with a canonical vWA fold. A restricted basic patch serves as the putative heparin binding site, but no heparin binding was detected in native gel shift assays. Furthermore, no metal was observed in the metal ion dependent adhesion site (MIDAS). Structural overlays with homologous A/I domains reveal a divergent organization of the MIDAS β4-α4 loop in TgMIC2A/Ic, which is stabilized through the burial of Phe195 into a deep pocket formed by Gly185. Intriguingly, Gly185 appears to be unique among A/I domains to TgMIC2A/I suggesting that the divergent loop conformation may also be unique to TgMIC2A/I. Although lacking the C-terminal extension, the TgMIC2A/Ic structure reported here is the first of an A/I domain from an apicomplexan parasite and provides valuable insight into defining the molecular recognition of host cells by these widespread pathogens.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».