Complete nucleotide sequence of the multidrug resistance IncA/C plasmid pR55 from Klebsiella pneumoniae isolated in 1969
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: To determine the complete nucleotide sequence of the multidrug resistance IncA/C plasmid pR55 from a clinical Klebsiella pneumoniae strain that was isolated from a urinary tract infection in 1969 in a French hospital and compare it with those of contemporary emerging IncA/C plasmids. METHODS: The plasmid was purified and sequenced using a 454 sequencing approach. After draft assembly, additional PCRs and walking reads were performed for gap closure. Sequence comparisons and multiple alignments with other IncA/C plasmids were done using the BLAST algorithm and CLUSTAL W, respectively. RESULTS: Plasmid pR55 (170 810 bp) revealed a shared plasmid backbone (>99% nucleotide identity) with current members of the IncA/C(2) multidrug resistance plasmid family that are widely disseminating antibiotic resistance genes. Nevertheless, two specific multidrug resistance gene arrays probably acquired from other genetic elements were identified inserted at conserved hotspot insertion sites in the IncA/C backbone. A novel transposon named Tn6187 showed an atypical mixed transposon configuration composed of two mercury resistance operons and two transposition modules that are related to Tn21 and Tn1696, respectively, and an In0-type integron. CONCLUSIONS: IncA/C(2) multidrug resistance plasmids have a broad host range and have been implicated in the dissemination of antibiotic resistance among Enterobacteriaceae from humans and animals. This typical IncA/C(2) genetic scaffold appears to carry various multidrug resistance gene arrays and is now also a successful vehicle for spreading AmpC-like cephalosporinase and metallo-β-lactamase genes, such as bla(CMY) and bla(NDM), respectively.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».