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Enregistrement W2099137652 · doi:10.1161/atvbaha.109.189522

Functional Analysis of the Chromosome 9p21.3 Coronary Artery Disease Risk Locus

2009· article· en· W2099137652 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueArteriosclerosis Thrombosis and Vascular Biology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueTGF-β signaling in diseases
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAlleleBiologyLocus (genetics)GeneGeneticsEnhancerGene expressionGenome-wide association studyCancer researchSingle-nucleotide polymorphismGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: We have investigated the functional significance of conserved sequences within the 9p21.3 risk locus for coronary artery disease (CAD) and determined the relationship of 9p21.3 to expression of ANRIL and to whole genome gene expression. METHODS AND RESULTS: We demonstrate that a conserved sequence within the 9p21.3 locus has enhancer activity and that the risk variant significantly increases reporter gene expression in primary aortic smooth muscle cells. Whole blood RNA expression of the short variants of ANRIL was increased by 2.2-fold whereas expression of the long ANRIL variant was decreased by 1.2-fold in healthy subjects homozygous for the risk allele. Expression levels of the long and short ANRIL variants were positively correlated with that of the cyclin-dependent kinase inhibitor, CDKN2B (p15) and TDGF1 (Cripto), respectively. Relevant to atherosclerosis, genome-wide expression profiling demonstrated upregulation of gene sets modulating cellular proliferation in carriers of the risk allele. CONCLUSIONS: These findings are consistent with the hypothesis that the 9p21.3 risk allele contains a functional enhancer, the activity of which is altered in carriers of the risk allele. 9p21.3 may promote atherosclerosis by regulating expression of ANRIL, which in turn is associated with altered expression of genes controlling cellular proliferation pathways.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,531
Score d'incertitude au seuil0,758

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle