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Enregistrement W2099160222 · doi:10.1128/ec.00152-06

Modulation of <i>Leishmania</i> ABC Protein Gene Expression through Life Stages and among Drug-Resistant Parasites

2006· article· en· W2099160222 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueEukaryotic Cell · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueResearch on Leishmaniasis Studies
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyLeishmania infantumGeneGeneticsGene expression profilingATP-binding cassette transporterDNA microarrayGenomeLeishmaniaComputational biologyAmastigoteGene expressionLeishmaniasisVisceral leishmaniasis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ATP-binding cassette (ABC) protein superfamily is one of the largest evolutionarily conserved families and is found in all kingdoms of life. The recent completion of the Leishmania genome sequence allowed us to analyze and classify its encoded ABC proteins. The complete sequence predicts a data set of 42 open reading frames (ORFs) coding for proteins belonging to the ABC superfamily, with representative members of every major subfamily (from ABCA to ABCH) commonly found in eukaryotes. Comparative analysis showed that the same ABC data set is found between Leishmania major and Leishmania infantum and that some orthologues are found in the genome of the related parasites Trypanosoma brucei and Trypanosoma cruzi. Customized DNA microarrays were made to assess ABC gene expression profiling throughout the two main Leishmania life stages. Two ABC genes (ABCA3 and ABCG3) are preferentially expressed in the amastigote stage, whereas one ABC gene (ABCF3) is more abundantly expressed in promastigotes. Microarray-based expression profiling experiments also revealed that three ABC genes (ABCA3, ABCC3, and ABCH1) are overexpressed in two independent antimony-resistant strains compared to the parental sensitive strain. All microarray results were confirmed by real-time reverse transcription-PCR assays. The present study provides a thorough phylogenic classification of the Leishmania ABC proteins and sets the basis for further functional studies on this important class of proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,101
Score d'incertitude au seuil0,794

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle