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Enregistrement W2099366101 · doi:10.1186/1471-2369-12-27

Renal kallikrein excretion and epigenetics in human acute kidney injury: Expression, mechanisms and consequences

2011· article· en· W2099366101 sur OpenAlexaff
Sun Woo Kang, Pei-an Betty Shih, Roy O. Mathew, Manjula Mahata, Nilima Biswas, Fangwen Rao, Liying Yan, Josée Bouchard, Rakesh Malhotra, Ashita Tolwani, Srikrishna Khandrika, Ravindra L. Mehta, Daniel T. O’Connor

Notice bibliographique

RevueBMC Nephrology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCoagulation, Bradykinin, Polyphosphates, and Angioedema
Établissements canadiensUniversité de MontréalHôpital du Sacré-Cœur de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institute on Minority Health and Health DisparitiesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteUniversity of California, San DiegoNational Institutes of HealthInje University
Mots-clésInternal medicineEndocrinologyExcretionBiologyKidneyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Renal kallikrein (KLK1) synthesis and urinary excretion are reportedly diminished during AKI (acute kidney injury) in animal models, and provision of kallikrein abrogates renal injury in this setting, but data in human AKI is limited. Therefore we first examined KLK1 renal excretion in human AKI, and then probed potential endocrine and epigenetic mechanisms for its alterations. METHODS: KLK1 enzymatic activity excretion was evaluated in urine from patients with established or incipient AKI, versus healthy/non-hospital as well as ICU controls. Endocrine control of KLK1 excretion was then probed by catecholamine and aldosterone measurements in established AKI versus healthy controls. To examine epigenetic control of KLK1 synthesis, we tested blood and urine DNA for changes in promoter CpG methylation of the KLK1 gene, as well as LINE-1 elements, by bisulfite sequencing. RESULTS: Patients with early/incipient AKI displayed a modest reduction of KLK1 excretion, but unexpectedly, established AKI displayed substantially elevated urine KLK1 excretion, ~11-fold higher than healthy controls, and ~3-fold greater than ICU controls. We then probed potential mechanisms of the change. Established AKI patients had lower SBP, higher heart rate, and higher epinephrine excretion than healthy controls, though aldosterone excretion was not different. Promoter KLK1 CpG methylation was higher in blood than urine DNA, while KLK1 methylation in blood DNA was significantly higher in established AKI than healthy controls, though KLK1 methylation in urine tended to be higher in AKI, directionally consistent with earlier/incipient but not later/established changes in KLK1 excretion in AKI. On multivariate ANOVA, AKI displayed coordinate changes in KLK1 excretion and promoter methylation, though directionally opposite to expectation. Control (LINE-1 repetitive element) methylation in blood and urine DNA was similar between AKI and controls. CONCLUSIONS: Unexpectedly, increased KLK1 excretion in AKI patients was found; this increase is likely to be due in part to increments in adrenergic tone during BP depression. Epigenetic changes at KLK1 may also play a role in early changes of KLK1 expression and thus AKI susceptibility or recovery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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