Protein gamma-radiolysis in frozen solutions is a macromolecular surface phenomenon: fragmentation of lysozyme, citrate synthase and alpha-lactalbumin in native or denatured states
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: To test whether radiolysis-induced fragmentation in frozen aqueous protein solution is dependent on solvent access to the surface of the protein or to the molecular mass of the polypeptide chain. MATERIALS AND METHODS: 60Co gamma-irradiation of three proteins at -78 degrees C: lysozyme, citrate synthase and alpha-lactalbumin in their native state, with or without bound substrate, or denatured (random coil in urea/acid-denatured state). RESULTS: By SDS-polyacrylamide gel electrophoresis/analysis of the protein-fragmentation process, it was found that for a given protein D37 values (dose to decrease the measured amount of protein, with an unaltered polypeptidic chain, to 37% of the initial amount) varied according to the state of the protein. D37 for denatured proteins was always much smaller than for native states, indicating a greater susceptibility to fragmentation. In urea, contrary to the native state, no well-defined fragments were observed. Radiolysis decay constants (K= 1/D37) increased with solvent-accessible surface area of these proteins estimated from their radii of gyration in the various states. This is shown also in previous data on native or SDS-denatured proteins. Denatured proteins which have a large surface area exposed to the solvent compared with native ones are more fragmented at equal doses. CONCLUSIONS: It is concluded that D37 is directly related to the exposed surface area and not to the molecular mass of the polypeptide chain.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».