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Enregistrement W2099466680 · doi:10.1242/jcs.113.1.153

Skh1, the MEK component of the Mkh1 signaling pathway in Schizosaccharomyces pombe

2000· article· en· W2099466680 sur OpenAlexaff
Robbie Loewith, Andrew V. Hubberstey, Dallan Young

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensHealth Sciences CentreUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSchizosaccharomyces pombeBiologyKinaseMAPK/ERK pathwayPhosphorylationMutantMitogen-activated protein kinaseProtein kinase AMolecular biologyCell biologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We previously reported the identification of Mkh1, a MEK kinase in Schizosaccharomyces pombe that is required for cell wall integrity, and we presented genetic evidence that Pmk1/Spm1, a MAP kinase, functions downstream from Mkh1 in the same pathway. Here, we report the identification of Skh1, a MEK (MAP kinase kinase) in S. pombe. The sequence of Skh1 is nearly identical to that of the recently reported Pek1 sequence. We present biochemical and genetic evidence that Skh1 is the MEK component of the Mkh1-Spm1 MAP kinase cascade. Our yeast two-hybrid results indicate that Mkh1, Skh1, and Spm1 physically interact to form a ternary complex. Deletion of mkh1, skh1 or spm1 results in identical phenotypes, including sensitivity to (beta)-glucanase treatment, growth inhibition on media containing KCl, and filamentous growth on medium containing caffeine. Double mutant strains exhibit phenotypes that are identical to the single mutant strains. Furthermore, expression of an activated HA-Skh1(DD )protein suppressed these defects in mkh1(delta) cells, and overexpression of Spm1 suppressed these defects in skh1(delta) cells. We also show that HA-Spm1 is hyper-phosphorylated on tyrosine residues in cells co-expressing the activated HA-Skh1(DD) protein. Furthermore, we found the phosphorylated/activated form of GFP-HA-Spm1 at detectable levels in wild-type cells, but not at appreciable levels in mkh1(delta) or skh1(delta) cells expressing this fusion protein. Together, our results indicate that Mkh1, Skh1 and Spm1 constitute a MAPK cascade in fission yeast.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,156

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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