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Enregistrement W2099481056 · doi:10.1002/humu.20799

<i>CRTAP</i>and<i>LEPRE1</i>mutations in recessive osteogenesis imperfecta

2008· article· en· W2099481056 sur OpenAlexafffund
Dustin Baldridge, Ulrike Schwarze, Roy Morello, Jennifer Lennington, Terry Bertin, James M. Pace, Melanie Pepin, MaryAnn Weis, David R. Eyre, Jennifer Walsh, Deborah M. Lambert, Andrew Green, H. B. Robinson, Melonie Michelson, Gunnar Houge, Carl Lindman, Judith Martin, Jewell C. Ward, Emmanuelle Lemyre, John J. Mitchell, Deborah Krakow, David L. Rimoin, Daniel H. Cohn, Peter H. Byers, Brendan Lee

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnective tissue disorders research
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesMinistry of Health, State of IsraelNational Center for Research ResourcesNational Institute of General Medical SciencesMcGill University
Mots-clésOsteogenesis imperfectaBiologyGeneticsType I collagenMutationGeneEndocrinologyAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Autosomal dominant osteogenesis imperfecta (OI) is caused by mutations in the genes (COL1A1 or COL1A2) encoding the chains of type I collagen. Recently, dysregulation of hydroxylation of a single proline residue at position 986 of both the triple-helical domains of type I collagen alpha1(I) and type II collagen alpha1(II) chains has been implicated in the pathogenesis of recessive forms of OI. Two proteins, cartilage-associated protein (CRTAP) and prolyl-3-hydroxylase-1 (P3H1, encoded by the LEPRE1 gene) form a complex that performs the hydroxylation and brings the prolyl cis-trans isomerase cyclophilin-B (CYPB) to the unfolded collagen. In our screen of 78 subjects diagnosed with OI type II or III, we identified three probands with mutations in CRTAP and 16 with mutations in LEPRE1. The latter group includes a mutation in patients from the Irish Traveller population, a genetically isolated community with increased incidence of OI. The clinical features resulting from CRTAP or LEPRE1 loss of function mutations were difficult to distinguish at birth. Infants in both groups had multiple fractures, decreased bone modeling (affecting especially the femurs), and extremely low bone mineral density. Interestingly, "popcorn" epiphyses may reflect underlying cartilaginous and bone dysplasia in this form of OI. These results expand the range of CRTAP/LEPRE1 mutations that result in recessive OI and emphasize the importance of distinguishing recurrence of severe OI of recessive inheritance from those that result from parental germline mosaicism for COL1A1 or COL1A2 mutations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations209
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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