Two Macrophage Colony-Stimulating Factor Genes Exist in Fish That Differ in Gene Organization and Are Differentially Expressed,
Notice bibliographique
Résumé
Mammalian macrophage CSF (MCSF; CSF-1) is the primary regulator of the mononuclear phagocyte lineage. We, for the first time, report the complete sequencing of five MCSF cDNAs from three fish species, rainbow trout, zebrafish, and goldfish. Despite the difference in the lengths of the MCSF transcripts, all of the fish MCSF molecules encode a signal peptide, a CSF-1 domain, a transmembrane domain, and an intracellular region. Each fish MCSF gene has a unique exon/intron structure. The primordial MCSF gene may have had a nine exon/eight intron structure. In this model, insertion of an intron in exon 6 in primitive fish created the fish type I MCSF, while the loss of this exon or part of the original exon 6 created the fish type II MCSF. Investigation of alternative splicing variants in trout suggests that no mammalian equivalent splice variants exist. The two trout MCSF genes are differentially expressed in vivo and contributed differently to the high-level expression of MCSF in spleen and head kidney. In contrast to the up-regulation of MCSF by PMA in mammals, in trout MCSF1 expression is down-regulated by PMA treatment. As in mammals, recombinant trout MCSF1 can promote the growth of head kidney leukocytes, and it up-regulates the expression of CXCR3 in head kidney macrophages, with the latter suggesting a role of MCSF in the trafficking of macrophages to sites of inflammation or injury where the CXCR3 ligands are expressed. Thus MCSF has an important role in the immune system of fish as in mammals.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».