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Enregistrement W2099574851 · doi:10.2217/14622416.9.2.157

Case–Control Study of the Association Between Select <i>HLA</i> Genes and Anti-Erythropoietin Antibody-Positive Pure Red-Cell Aplasia

2008· article· en· W2099574851 sur OpenAlexaboutno aff
Bonnie A. Fijal, Deborah Ricci, Els Vercammen, Peter Palmer, Fotis Fotiou, Daniel Fife, Anders Lindholm, Erin Broderick, Stephan Francke, Xiaodong Wu, James Colaianne, Nadine Cohen

Notice bibliographique

RevuePharmacogenomics · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBiosimilars and Bioanalytical Methods
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPure red cell aplasiaErythropoietinAntibodyHuman leukocyte antigenGeneAplasiaImmunologyMedicineBiologyGeneticsInternal medicineAntigenAnemia

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: Antibody (Ab)-positive pure red-cell aplasia (PRCA) is a very rare but serious adverse event associated with recombinant human erythropoietin treatment (4.1 reports per 100,000 patient-years) in which patients produce antibodies to recombinant and endogenous erythropoietin, halting red blood cell production. In a previous case series, four Thai subjects with chronic kidney disease and Ab-positive PRCA were reported to have the HLA-DRB1*9 allele. To confirm a possible association of HLA-DRB1*9 and Ab-positive PRCA, we performed a pharmacogenomic analysis using subjects from an earlier case-control study of risk factors associated with Ab-positive PRCA, which had been performed using subjects from Europe or Canada. The primary goal of the analysis was to test the association between HLA-DRB1*9 and Ab-positive PRCA. A secondary goal was to perform an exploratory analysis in order to identify additional HLA alleles potentially associated with Ab-positive PRCA. PATIENTS & METHODS: Subjects were taken from a case-control study of Ab-positive PRCA in chronic kidney disease patients treated in Europe or Canada. Ab-positive PRCA cases (n=24) were matched to controls (n=81) by timing of treatment exposure and, when possible, by location. RESULTS: The allele frequency of HLA-DRB1*9 was 12.5% in cases vs 1.2% in controls (p=0.002). The frequency of the HLA-DRB1*9/other genotype was 25.0% in cases vs 2.5% in controls (p=0.004; OR: 10.8 [95% CI: 2.2-53.7]). Within the exploratory analysis, six additional HLA alleles (HLA-A*25, HLA-B*53, HLA-C*12, HLA-DQB1*3, HLA-DQB1*6 and HLA-DRB1*4) were also found to be associated with Ab-positive PRCA. CONCLUSION: This study confirmed that HLA-DRB1*9 occurs at a significantly higher frequency in Ab-positive PRCA cases than in controls; however, within this sample set, carrying the *9 allele was neither necessary nor sufficient to cause Ab-positive PRCA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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