Proteomic analysis and immunodetection of the bovine milk osteopontin isoforms
Notice bibliographique
Résumé
The aim of this study was to characterize the osteopontin (OPN) secreted in bovine milk and to determine whether the different forms are the product of spliced variants. Spliced variants of the human gene and secreted osteopontin isoforms have been reported in human tumor tissue. In bovine milk, we identified 2 major forms: one corresponding to the full-length coding transcript and a truncated version of this form. No alternative spliced transcripts were detected in the lactating mammary gland tissue, in milk somatic cells, or in peripheral blood immune cells. The 60-kDa bovine osteopontin (bOPN) and a truncated 40-kDa protein isoform were confirmed by mass spectrometry and further characterized by immunoblotting using a panel of 6 antibodies targeting different domains of the protein. Of the 3 human anti-OPN antibodies targeting the N-terminal segment of the protein, only one detected all forms on sodium dodecyl sulfate-PAGE; one human anti-OPN antibody failed to detect bOPN, whereas the other detected only the 60-kDa protein, albeit barely in its phosphorylated form. Detection was generally more sensitive when the 60-kDa protein was dephosphorylated. Two polyclonal antibodies raised against bOPN were tested: one targeting the milk-purified bOPN (bOPN-121) and one targeting a bovine epitope (synthetic peptide) corresponding to a carboxy-terminal domain of the protein (bOPN-117). The bOPN-121 antibody detected all forms irrespective of the phosphorylation status of bOPN. The bOPN-117 and the mouse anti-human OPN (hOPN-4) antibodies, which recognized different domains of the carboxy-terminal segment of the protein, also preferentially detected the dephosphorylated 60-kDa protein. Whereas phosphorylation had a major effect on detection for several antibodies, deglycosylation slightly decreased immunodetection for the tested antibodies. In particular, phosphorylation is the major posttranslational modification that influenced the weak detection capacity of several antibodies. This fact needs to be taken into account for immunodetection of milk content. In conclusion, the OPN forms secreted in bovine milk are not the product of alternative splicing. The 40-kDa protein appears to be a truncated hypophosphorylated variant of the full-length 60-kDa form, which is highly phosphorylated. Together, the proteomic and immunoblotting analyses used to characterize bovine milk OPN revealed the complex nature of the bovine milk OPN forms.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».