Type 1 Diabetes in the BB Rat: A Polygenic Disease
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: Two type 1 diabetes susceptibility genes have been identified in the spontaneously diabetic biobreeding diabetes-prone (BBDP) rat, the major histocompatibility complex (MHC) (RT1) class II u haplotype (Iddm1) and Gimap5 (Iddm2). The strong effects of these have impeded previous efforts to map additional loci. We tested the hypothesis that type 1 diabetes is a polygenic disease in the BBDP rat. RESEARCH DESIGN AND METHODS: We performed the most comprehensive genome-wide linkage analysis for type 1 diabetes, age of disease onset (AOO), and insulitis subphenotypes in 574 F2 animals from a cross-intercross between BBDP and type 1 diabetes-resistant, double congenic ACI.BBDP-RT1u,Gimap5 (ACI.BB(1u.lyp)) rats, where both Iddm1 and Iddm2 were fixed as BBDP. RESULTS: A total of 19% of these F2 animals developed type 1 diabetes, and eight type 1 diabetes susceptibility loci were mapped, six showing significant linkage (chromosomes 1, 3, 6 [two loci], 12, and 14) and two (chromosomes 2 and 17) suggestive linkage. The chromosomes 6, 12, and 14 intervals were also linked to the severity of islet infiltration by immunocytes, while those on chromosomes 1, 6 (two loci), 14, 17, and a type 1 diabetes-unlinked chromosome 8 interval showed significant linkage to the degree of islet atrophy. Four loci exhibited suggestive linkage to AOO on chromosomes 2 (two loci), 7, and 18 but were unlinked to type 1 diabetes. INS, PTPN22, IL2/IL21, C1QTNF6, and C12orf30, associated with human type 1 diabetes, are contained within the chromosomes 1, 2, 7, and 12 loci. CONCLUSIONS: This study demonstrates that the BBDP diabetic syndrome is a complex, polygenic disease that may share additional susceptibility genes besides MHC class II with human type 1 diabetes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».