Differential Expression of Porins OmpP2A and OmpP2B of <i>Haemophilus ducreyi</i>
Notice bibliographique
Résumé
Haemophilus ducreyi is a strict human pathogen and the causative agent of the sexually transmitted disease chancroid. The genome of the human-passaged strain of H. ducreyi (35000HP) contains two homologous genes whose protein products have estimated molecular masses of 46 and 43 kDa. A comparative analysis of the deduced amino acid sequences revealed that these proteins share 27 to 33% identity to the outer membrane protein P2 (OmpP2), a major porin of Haemophilus influenzae. Therefore, these proteins have been designated OmpP2A and OmpP2B, respectively. The detection of ompP2A and ompP2B transcripts by reverse transcriptase PCR indicated that these genes were independently transcribed in H. ducreyi 35000HP. Western blot analysis of outer membrane proteins isolated from a geographically diverse collection of H. ducreyi clinical isolates revealed that OmpP2A and OmpP2B were differentially expressed among these strains. Although PCR analysis suggested that ompP2A and ompP2B were conserved among the strains tested, the differential expression observed was due to nucleotide additions and partial gene deletions. Purified OmpP2A and OmpP2B were isolated under nondenaturing conditions, and subsequent analysis demonstrated that these two proteins exhibited porin activity. OmpP2A and OmpP2B are the first porins described for H. ducreyi.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».