Functional Conservation of the Polysaccharide Biosynthetic Protein WbpM and Its Homologues in <i>Pseudomonas aeruginosa</i> and Other Medically Significant Bacteria
Notice bibliographique
Résumé
WbpM is a highly conserved protein involved in synthesis of the O antigens of Pseudomonas aeruginosa. Homologues of this protein have been identified in a large number of bacteria, and they can be divided into two subfamilies: subfamily 1, including WbpM, contains large proteins ( approximately 600 amino acids), while subfamily 2, typified by HP0840 (FlaA1) of Helicobacter pylori, contains smaller proteins ( approximately 350 amino acids) homologous to the C termini of proteins in subfamily 1. Analysis of knockout mutants of wbpM in P. aeruginosa serotypes O3, O10, O15, and O17 showed that although all 20 serotypes of P. aeruginosa possess wbpM, it is not universally required for O-antigen biosynthesis. Homologous genes from Bordetella pertussis (wlbL), Staphylococcus aureus (cap8D), and H. pylori (flaA1) complemented a P. aeruginosa O5 wbpM mutant to various degrees. These conserved proteins may represent interesting targets for the design of inhibitors of bacterial exopolysaccharide biosynthesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».