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Enregistrement W2099902384 · doi:10.1128/jvi.78.6.2808-2818.2004

Structural and Functional Properties of an Unusual Internal Fusion Peptide in a Nonenveloped Virus Membrane Fusion Protein

2004· article· en· W2099902384 sur OpenAlexaff
Maya Shmulevitz, Richard M. Epand, Roy Duncan

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensMcMaster UniversityDalhousie University
Organismes subventionnairesShanghai Ocean University
Mots-clésLipid bilayer fusionEctodomainBiologyFusion mechanismViral envelopeFusionViral membraneViral entryPeptideFusion proteinCell fusionVirusBiophysicsBiochemistryViral replicationVirologyCellRecombinant DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The avian and Nelson Bay reoviruses are two of only a limited number of nonenveloped viruses capable of inducing cell-cell membrane fusion. These viruses encode the smallest known membrane fusion proteins (p10). We now show that a region of moderate hydrophobicity we call the hydrophobic patch (HP), present in the small N-terminal ectodomain of p10, shares the following characteristics with the fusion peptides of enveloped virus fusion proteins: (i) an abundance of glycine and alanine residues, (ii) a potential amphipathic secondary structure, (iii) membrane-seeking characteristics that correspond to the degree of hydrophobicity, and (iv) the ability to induce lipid mixing in a liposome fusion assay. The p10 HP is therefore predicted to provide a function in the mechanism of membrane fusion similar to those of the fusion peptides of enveloped virus fusion peptides, namely, association with and destabilization of opposing lipid bilayers. Mutational and biophysical analysis suggested that the internal fusion peptide of p10 lacks alpha-helical content and exists as a disulfide-stabilized loop structure. Similar kinked structures have been reported in the fusion peptides of several enveloped virus fusion proteins. The preservation of a predicted loop structure in the fusion peptide of this unusual nonenveloped virus membrane fusion protein supports an imperative role for a kinked fusion peptide motif in biological membrane fusion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,390

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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