Comparison of the Vitek Gram-Positive Susceptibility 106 Card, the MRSA-Screen Latex Agglutination Test, and <i>mecA</i> Analysis for Detecting Oxacillin Resistance in a Geographically Diverse Collection of Clinical Isolates of Coagulase-Negative Staphylococci
Notice bibliographique
Résumé
The Vitek automated susceptibility testing system with a modified gram-positive susceptibility (GPS) 106 card (bioMerieux Vitek, Inc., Hazelwood. Mo.) and a rapid slide latex agglutination test (MRSA-Screen test; Denka Seiken Co., Ltd., Tokyo, Japan) were evaluated for their abilities to detect oxacillin resistance in coagulase-negative staphylococci (CoNS). The reference broth microdilution method and the detection of the mecA gene by PCR ("gold standard" reference result) were used to compare the results obtained with the commercial products. A total of 123 clinical isolates consisting of eight species were selected from U.S. surveillance collections. Among the mecA-positive isolates (95 strains), 30 isolates were initially negative on the MRSA-Screen test read at 3 min. When the agglutination reaction was extended for 10 min, 26 of the 30 isolates became positive. For a different four isolates, the oxacillin MIC was < or =0.25 microg/ml on the Vitek GPS 106 card. Among the mecA-negative isolates (28 strains), for two Staphylococcus warneri, two S. lugdunensis, and two S. saprophyticus strains MICs were > or =0.5 microg/ml by the reference broth microdilution method. Four of these isolates were also categorized as resistant with the Vitek GPS 106 card and two isolates were positive by the MRSA-Screen test. Overall, the MRSA-Screen test, GPS 106 card, and reference broth microdilution method had sensitivities of 95.7 (result at 10 min), 95.7, and 100%, respectively, and specificities of 92.8, 85.7, and 78.5%, respectively. Although the MRSA-Screen test required a slight procedural modification, both commercial methods achieved a sensitivity and specificity at detecting oxacillin resistance in CoNS at a level that was acceptable for clinical laboratory use.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».