In vitro susceptibility of Candida species to five antifungal agents in a German university hospital assessed by the reference broth microdilution method and Etest
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: The aim of this study is to evaluate the susceptibilities of Candida spp. to the common antifungal agents in a German university hospital. Since quick results of in vitro testing are desirable, Etest and the CLSI broth microdilution (BMD) method (reference method) were compared, focusing on the validity of early readings. METHODS: A total of 512 Candida spp. isolates, including 174 from primarily sterile sites, were collected in the clinical routine. The yeasts were differentiated by CHROMagar and verified by API 20C AUX if necessary. In vitro susceptibilities to amphotericin B, flucytosine, fluconazole, voriconazole and caspofungin were determined using the BMD method described in the CLSI (formerly NCCLS) M27-A2 document and Etest. MICs were noted after 24 and 48 h of incubation. RESULTS: The most frequently isolated species was Candida albicans. Among the non-albicans species, Candida glabrata was the most prevalent, followed by Candida tropicalis, Candida parapsilosis and Candida krusei. MICs (mg/L) at which 90% of the strains were inhibited were 1 for amphotericin B, 32 for flucytosine, 8 for fluconazole, 0.25 for voriconazole and 1 for caspofungin. Susceptibility to fluconazole was 85.0% for C. glabrata and 5.3% for C. krusei, almost all other isolates were susceptible in over 90% except very rare species. The 48 h MIC values of Etest and BMD were in agreement (no more than 2 log(2) dilutions) in 88.7% to 98.1% with categorical agreement rates of 91.6% to 98.2%, depending on the antifungal agent. Comparison of the 24 h MICs of both BMD and Etest with the 48 h MICs of the reference method showed categorical agreement in 94.9% to 99.2%. For caspofungin, however, a comparison of the categorical agreement was not possible due to the lack of interpretive breakpoints. The order of frequency and the resistance patterns of the isolates from primarily sterile sites and those of isolates from non-sterile sites did not differ. CONCLUSIONS: No alarming resistances against the agents tested were found; however, owing to the relatively high frequency of C. glabrata with elevated fluconazole MICs, this species and, to a certain extent, C. krusei must be taken into consideration when choosing antifungal agents for calculated therapy. Etest is a reliable method for the susceptibility testing of Candida spp. and the 24 h readings of both Etest and BMD can serve as helpful preliminary results in most cases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».