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Enregistrement W2100008775 · doi:10.1093/jac/dkl555

In vitro susceptibility of Candida species to five antifungal agents in a German university hospital assessed by the reference broth microdilution method and Etest

2007· article· en· W2100008775 sur OpenAlexfundno aff
Ralf Fleck, Annebärbel Dietz, Herbert Hof

Notice bibliographique

RevueJournal of Antimicrobial Chemotherapy · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesGilead SciencesValeant Pharmaceuticals InternationalPfizer
Mots-clésEtestBroth microdilutionAntifungalMedicineMicrobiologyMinimum inhibitory concentrationBiologyAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: The aim of this study is to evaluate the susceptibilities of Candida spp. to the common antifungal agents in a German university hospital. Since quick results of in vitro testing are desirable, Etest and the CLSI broth microdilution (BMD) method (reference method) were compared, focusing on the validity of early readings. METHODS: A total of 512 Candida spp. isolates, including 174 from primarily sterile sites, were collected in the clinical routine. The yeasts were differentiated by CHROMagar and verified by API 20C AUX if necessary. In vitro susceptibilities to amphotericin B, flucytosine, fluconazole, voriconazole and caspofungin were determined using the BMD method described in the CLSI (formerly NCCLS) M27-A2 document and Etest. MICs were noted after 24 and 48 h of incubation. RESULTS: The most frequently isolated species was Candida albicans. Among the non-albicans species, Candida glabrata was the most prevalent, followed by Candida tropicalis, Candida parapsilosis and Candida krusei. MICs (mg/L) at which 90% of the strains were inhibited were 1 for amphotericin B, 32 for flucytosine, 8 for fluconazole, 0.25 for voriconazole and 1 for caspofungin. Susceptibility to fluconazole was 85.0% for C. glabrata and 5.3% for C. krusei, almost all other isolates were susceptible in over 90% except very rare species. The 48 h MIC values of Etest and BMD were in agreement (no more than 2 log(2) dilutions) in 88.7% to 98.1% with categorical agreement rates of 91.6% to 98.2%, depending on the antifungal agent. Comparison of the 24 h MICs of both BMD and Etest with the 48 h MICs of the reference method showed categorical agreement in 94.9% to 99.2%. For caspofungin, however, a comparison of the categorical agreement was not possible due to the lack of interpretive breakpoints. The order of frequency and the resistance patterns of the isolates from primarily sterile sites and those of isolates from non-sterile sites did not differ. CONCLUSIONS: No alarming resistances against the agents tested were found; however, owing to the relatively high frequency of C. glabrata with elevated fluconazole MICs, this species and, to a certain extent, C. krusei must be taken into consideration when choosing antifungal agents for calculated therapy. Etest is a reliable method for the susceptibility testing of Candida spp. and the 24 h readings of both Etest and BMD can serve as helpful preliminary results in most cases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,438
Score d'incertitude au seuil0,504

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations85
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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