Microsatellite Instability in Arabidopsis Increases with Plant Development
Notice bibliographique
Résumé
Plant development consists of the initial phase of intensive cell division followed by continuous genome endoreduplication, cell growth, and elongation. The maintenance of genome stability under these conditions is the main task performed by DNA repair and genome surveillance mechanisms. Our previous work showed that the rate of homologous recombination repair in older plants decreases. We hypothesized that this age-dependent decrease in the recombination rate is paralleled with other changes in DNA repair capacity. Here, we analyzed microsatellite stability using transgenic Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) plants that carry the nonfunctional β-glucuronidase gene disrupted by microsatellite repeats. We found that microsatellite instability increased dramatically with plant age. We analyzed the contribution of various mechanisms to microsatellite instability, including replication errors and mistakes of DNA repair mechanisms such as mismatch repair, excision repair, and strand break repair. Analysis of total DNA polymerase activity using partially purified protein extracts showed an age-dependent decrease in activity and an increase in fidelity. Analysis of the steady-state RNA level of DNA replicative polymerases α, δ, Pol I-like A, and Pol I-like B and the expression of mutS homolog 2 (Msh2) and Msh6 showed an age-dependent decrease. An in vitro repair assay showed lower efficiency of nonhomologous end joining in older plants, paralleled by an increase in Ku70 gene expression. Thus, we assume that the more frequent involvement of nonhomologous end joining in strand break repair and the less efficient end-joining repair together with lower levels of mismatch repair activities may be the main contributors to the observed age-dependent increase in microsatellite instability.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».