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Enregistrement W2100155812 · doi:10.1093/jnci/djk150

Instability of BCR-ABL Gene in Primary and Cultured Chronic Myeloid Leukemia Stem Cells

2007· article· en· W2100155812 sur OpenAlexaff
Xiaoyan Jiang, Kyi Min Saw, Allen Eaves, Connie J. Eaves

Notice bibliographique

RevueJNCI Journal of the National Cancer Institute · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Myeloid Leukemia Treatments
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMyeloid leukemiaStem cellCancer researchbreakpoint cluster regionGeneABLBiologyCell biologyGeneticsTyrosine kinaseSignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Imatinib mesylate treatment causes remissions in a majority of patients with chronic myeloid leukemia (CML), but relapses are an increasing problem. We hypothesized that imatinib-resistant leukemic cells emerge from CML stem cells that acquire BCR-ABL gene mutations even before exposure to BCR-ABL-targeted agents such as imatinib. METHODS: Lineage-negative (i.e., immature) CD34+ CD38- CML stem cell-enriched populations were isolated from five patients with chronic phase CML samples by fluorescence-activated cell sorting. To identify BCR-ABL gene mutations, complementary DNAs (cDNAs) prepared from purified CML stem cells were subjected to allele-specific amplification using primers corresponding to 16 kinase domain mutations, with normal bone marrow cells serving as negative controls. We also cloned and directly sequenced BCR-ABL cDNAs prepared from freshly isolated CML stem cells and from their progeny generated after 3-5 weeks of culture. RESULTS: In 20%-33% of cDNA preparations from freshly isolated CML stem cell-enriched populations, both allele-specific amplification and direct sequencing methods revealed mutations in sequences corresponding to the BCR-ABL kinase domain. Mutations were not observed in cDNA sequences encoding the c-ABL kinase domain that were obtained from similar types of primitive normal cells. More than 70 different BCR-ABL mutations (including frameshift mutations and premature stop codons) were identified in the progeny of cultured CML stem cells. Analysis of individual clones derived from the cultured cells demonstrated that new BCR-ABL mutations were produced. CONCLUSIONS: Primary CML stem cells display instability of the BCR-ABL fusion gene both in vivo and in vitro. Thus, patients may possess leukemic stem cells with BCR-ABL kinase mutations before initiation of BCR-ABL-targeted therapies and would likely be predisposed to develop resistance to these agents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,477
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations135
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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