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Enregistrement W2100206189 · doi:10.1093/genetics/163.1.9

Genetic Analysis of the Interface Between Cdc42p and the CRIB Domain of Ste20p in <i>Saccharomyces cerevisiae</i>

2003· article· en· W2100206189 sur OpenAlexaff
Josée Ash, Cunle Wu, Robert Larocque, Maleek Jamal, Willem K. Stevens, David Y. Thomas, Malcolm Whiteway

Notice bibliographique

RevueGenetics · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensMcGill UniversityBiotechnology Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMutantSaccharomyces cerevisiaeMutagenesisGeneticsCDC42Cell biologyGeneGTPase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutagenesis was used to probe the interface between the small GTPase Cdc42p and the CRIB domain motif of Ste20p. Members of a cluster of hydrophobic residues of Cdc42p were changed to alanine and/or arginine. The interaction of the wild-type and mutant proteins was measured using the two-hybrid assay; many, but not all, changes reduced interaction between Cdc42p and the target CRIB domain. Mutations in conserved residues in the CRIB domain were also tested for their importance in the association with Cdc42p. Two conserved CRIB domain histidines were changed to aspartic acid. These mutants reduced mating, as well as responsiveness to pheromone-induced gene expression and cell cycle arrest, but did not reduce in vitro the kinase activity of Ste20p. GFP-tagged mutant proteins were unable to localize to sites of polarized growth. In addition, these point mutants were synthetically lethal with disruption of CLA4 and blocked the Ste20p-Cdc42p two-hybrid interaction. Compensatory mutations in Cdc42p that reestablished the two-hybrid association with the mutant Ste20p CRIB domain baits were identified. These mutations improved the pheromone responsiveness of cells containing the CRIB mutations, but did not rescue the lethality associated with the CRIB mutant CLA4 deletion interaction. These results suggest that the Ste20p-Cdc42p interaction plays a direct role in Ste20p kinase function and that this interaction is required for efficient activity of the pheromone response pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,237
Score d'incertitude au seuil0,359

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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