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Enregistrement W2100230804 · doi:10.1002/ajmg.a.30005

A novel missense mutation in the galactosyltransferase‐I (<i>B4GALT7</i>) gene in a family exhibiting facioskeletal anomalies and Ehlers–Danlos syndrome resembling the progeroid type

2004· article· en· W2100230804 sur OpenAlexaff
Muhammad Faiyaz‐Ul‐Haque, Syed Hassan Ejaz Zaidi, Mariam Al‐Ali, Mariam Al‐Mureikhi, Shelley Kennedy, Ghalia M.H Al-Thani, Lap‐Chee Tsui, Ahmad S. Teebi

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnective tissue disorders research
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMissense mutationEhlers–Danlos syndromeGeneticsBiologyGalactosyltransferaseMutationGeneMedicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Ehlers-Danlos syndrome (EDS) is a heterogeneous group of heritable connective tissue disorders characterized by skin hyperextensibility, joint hypermobility, and tissue fragility. Several genes have been implicated to result in EDS phenotypes. The progeroid type of EDS is characterized by wrinkled, loose skin on the face, curly fine hair, scanty eyebrows and eyelashes, in addition to the classical features of EDS. Here we describe two similarly affected individuals in two sibships of a large consanguineous family from Qatar. DNA samples from affected and unaffected members of the family were analyzed for homozygosity of polymorphic markers associated with genes that have been implicated in EDS. Among 28 markers analyzed, homozygosity was only observed for D5S469 and D5S2111, which were markers for galactosyltransferase-I (B4GALT7) located on chromosome 5q35.2, where the previously reported progeroid-like variant of EDS has been mapped. Exons harboring the coding regions and exon-intron junctions of B4GALT7 were amplified by PCR and examined for mutations. A homozygous misssense C to T substitution at nucleotide 808 in the coding region was discovered in both affected individuals. The carrier parents were heterozygous for this mutation, which was not found among 76 DNA samples from control individuals of the same ethnicity. Segregation of this novel mutation in the family further confirmed the allelic variant and its recessive mode of inheritance in this type of EDS. The C to T substitution results in an arginine to cysteine change at amino acid residue 270 that is located in the catalytically active extracellular C-terminal domain. This change could result in abnormal protein folding and/or aberrant interactions of mutated galactosyltransferase-I with other extracellular matrix proteins leading to the development of a progeroid-like phenotype in affected individuals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,787
Score d'incertitude au seuil0,406

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations109
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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