Crystal structure reveals specific recognition of a G-quadruplex RNA by a β-turn in the RGG motif of FMRP
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Notice bibliographique
Résumé
Fragile X Mental Retardation Protein (FMRP) is a regulatory RNA binding protein that plays a central role in the development of several human disorders including Fragile X Syndrome (FXS) and autism. FMRP uses an arginine-glycine-rich (RGG) motif for specific interactions with guanine (G)-quadruplexes, mRNA elements implicated in the disease-associated regulation of specific mRNAs. Here we report the 2.8-Å crystal structure of the complex between the human FMRP RGG peptide bound to the in vitro selected G-rich RNA. In this model system, the RNA adopts an intramolecular K(+)-stabilized G-quadruplex structure composed of three G-quartets and a mixed tetrad connected to an RNA duplex. The RGG peptide specifically binds to the duplex-quadruplex junction, the mixed tetrad, and the duplex region of the RNA through shape complementarity, cation-π interactions, and multiple hydrogen bonds. Many of these interactions critically depend on a type I β-turn, a secondary structure element whose formation was not previously recognized in the RGG motif of FMRP. RNA mutagenesis and footprinting experiments indicate that interactions of the peptide with the duplex-quadruplex junction and the duplex of RNA are equally important for affinity and specificity of the RGG-RNA complex formation. These results suggest that specific binding of cellular RNAs by FMRP may involve hydrogen bonding with RNA duplexes and that RNA duplex recognition can be a characteristic RNA binding feature for RGG motifs in other proteins.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle