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Enregistrement W2100327440 · doi:10.1111/j.1365-294x.2009.04247.x

A quantitative review of heterozygosity–fitness correlations in animal populations

2009· review· en· W2100327440 sur OpenAlexaff
Joanne R. Chapman, Shinichi Nakagawa, David W. Coltman, Jon Slate, Ben C. Sheldon

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2009
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesTertiary Education Commission
Mots-clésBiologyInbreedingTraitUnivariateEvolutionary biologyMultivariate statisticsQuantitative geneticsGenetic variationPopulationSelection (genetic algorithm)HeritabilityLoss of heterozygosityStatisticsGeneticsDemographyAlleleGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ease of obtaining genotypic data from wild populations has renewed interest in the relationship between individual genetic diversity and fitness-related traits (heterozygosity-fitness correlations, or HFC). Here we present a comprehensive meta-analysis of HFC studies using powerful multivariate techniques which account for nonindependence of data. We compare these findings with those from univariate techniques, and test the influence of a range of factors hypothesized to influence the strength of HFCs. We found small but significantly positive effect sizes for life-history, morphological, and physiological traits; while theory predicts higher mean effect sizes for life-history traits, effect size did not differ consistently with trait type. Newly proposed measures of variation were no more powerful at detecting relationships than multilocus heterozygosity, and populations predicted to have elevated inbreeding variance did not exhibit higher mean effect sizes. Finally, we found evidence for publication bias, with studies reporting weak, nonsignificant effects being under-represented in the literature. In general, our review shows that HFC studies do not generally reveal patterns predicted by population genetic theory, and are of small effect (less than 1% of the variance in phenotypic characters explained). Future studies should use more genetic marker data and utilize sampling designs that shed more light on the biological mechanisms that may modulate the strength of association, for example by contrasting the strength of HFCs in mainland and island populations of the same species, investigating the role of environmental stress, or by considering how selection has shaped the traits under investigation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,023
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,032

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,023
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0110,013
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,356
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations461
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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