Rapid differentiation of the closely related<i>Kluyveromyces lactis</i>var.<i>lactis</i>and<i>K. marxianus</i>strains isolated from dairy products using selective media and PCR/RFLP of the rDNA non transcribed spacer 2
Notice bibliographique
Résumé
PCR/RFLP of the NTS2 (IGS2) of rDNA was applied to differentiate two closely related yeast species, Kluyveromyces lactis var. lactis (referred to as K. lactis) and K. marxianus. Using specific primers, the NTS2 region was amplified from DNA of both K. lactis and K. marxianus type and collection strains. AluI restriction of amplified fragments generated patterns characteristic for each species. The NTS2 region from K. lactis var. drosophilarum and related species K. aestuarii, K. africanus, K. dobzhanskii, and K. wickerhamii could also be amplified with the same primers, but AluI patterns generated were clearly different. PCR/RFLP of the NTS2 appears thus to be a convenient method for rapid identification of K. lactis and K. marxianus, frequently found in dairy products. This test was validated therefore on K. lactis and K. marxianus from natural habitats. We showed that all yeast strains collected from whey samples and scoring blue on X-gal glucose plates were either K. lactis or K. marxianus. For application purposes, we propose here an approach for quickly screening for K. lactis/marxianus and Saccharomyces cerevisiae in dairy products using X-gal coloured and lysine growth media.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».