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Enregistrement W2100492328 · doi:10.1074/jbc.m102073200

Direct Identification of Human Oxytocin Receptor-binding Domains Using a Photoactivatable Cyclic Peptide Antagonist

2001· article· en· W2100492328 sur OpenAlexaff
Christophe Breton, Hichem Chellil, Majida Kabbaj-Benmansour, Eric Carnazzi, René Seyer, Sylvie Phalipou, Denis Morin, Thierry Durroux, Hans H. Zingg, Claude Barberis, Bernard Mouillac

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomainePsychology
ThématiqueNeuroendocrine regulation and behavior
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésReceptorChinese hamster ovary cellPhotoaffinity labelingOxytocin receptorVasopressin receptorChemistryOxytocinLigand (biochemistry)StereochemistryBinding siteAntagonistBiochemistryBiologyEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Understanding of the molecular determinants responsible for antagonist binding to the oxytocin receptor should provide important insights that facilitate rational design of potential therapeutic agents for the treatment of preterm labor. To study ligand/receptor interactions, we used a novel photosensitive radioiodinated antagonist of the human oxytocin receptor, d(CH(2))(5) [Tyr(Me)(2),Thr(4),Orn(8),Phe(3(125)I,4N(3))-NH(2)9]vasotocin. This ligand had an equivalent high affinity for human oxytocin and V(1a) vasopressin receptors expressed in Chinese hamster ovary cells. Taking advantage of this dual specificity, we conducted photoaffinity labeling experiments on both receptors. Photolabeled oxytocin and V(1a) receptors appeared as a unique protein band at 70-75 kDa and two labeled protein bands at 85-90 and 46 kDa, respectively. To identify contact sites between the antagonist and the receptors, the labeled 70-75- and the 46-kDa proteins were cleaved with CNBr and digested with Lys-C and Arg-C endoproteinases. The fragmentation patterns allowed the identification of a covalently labeled region in the oxytocin receptor transmembrane domain III consisting of the residues Leu(114)-Val(115)-Lys(116). Analysis of contact sites in the V(1a) receptor led to the identification of the homologous region consisting of the residues Val(126)-Val(127)-Lys(128). Binding domains were confirmed by mutation of several CNBr cleavage sites in the oxytocin receptor and of one Lys-C cleavage site in the V(1a) receptor. The results are in agreement with previous experimental data and three-dimensional models of agonist and antagonist binding to members of the oxytocin/vasopressin receptor family.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,070
Tête enseignante GPT0,362
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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