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Enregistrement W2100612552 · doi:10.1128/iai.69.6.3791-3799.2001

Variance in Fibronectin Binding and <i>fnb</i> Locus Polymorphisms in <i>Staphylococcus aureus</i> : Identification of Antigenic Variation in a Fibronectin Binding Protein Adhesin of the Epidemic CMRSA-1 Strain of Methicillin-Resistant <i>S. aureus</i>

2001· article· en· W2100612552 sur OpenAlexafffund
Kelly C. Rice, Mario Huesca, Dareyl Vaz, Martin J. McGavin

Notice bibliographique

RevueInfection and Immunity · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensWomen's College HospitalUniversity of TorontoSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyBacterial adhesinAntigenic variationGeneticsGeneLocus (genetics)Staphylococcus aureusGenetic variationVirulenceBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The fnbA and fnbB genes of Staphylococcus aureus 8325-4 encode fibronectin (Fn) binding proteins FnBPA and FnBPB, which promote adherence to host tissues. Each adhesin contains three copies of a repeated D motif that binds Fn and is a target for vaccine development. In this study, we assess variability within the Fn-binding domain of the FnBP adhesins and evaluate factors that promote variance in Fn binding among clinical isolates. Based on variation in the number of fnb genes or the number of D motifs, we identified five polymorphism groups. S. aureus 8325-4 and 91% of methicillin-resistant S. aureus (MRSA) isolates belong to polymorphism group I, with two fnb genes and three copies of the D motif. Polymorphism group II contained one fnb gene with only two D motifs and was associated with the epidemic CMRSA-4 strain, which exhibited high protease activity and low Fn binding. Polymorphism group III was unique to the epidemic CMRSA-1 strain, defined by the presence of a fourth D motif that exhibited antigenic variation within a conserved sequence that is essential for Fn binding. However, the sequence of the D motifs was otherwise highly conserved among the other polymorphism groups. Variation in Fn binding among MRSA isolates was inversely related to protease activity but not to the number of fnb genes or the number of D motifs. Therefore, the fnb locus is polymorphic in a small number of strains, but this does not contribute to variation in Fn binding. The antigenic variation that was observed only in the epidemic CMRSA-1 strain may have evolved in response to a host immune response encountered during successive cycles of colonization, transmission, and infection in the nosocomial environment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,416
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2001
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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