Structure of Ca<sup>2+</sup>-loaded human grancalcin
Notice bibliographique
Résumé
Grancalcin is a cytosolic Ca(2+)-binding protein originally identified in human neutrophils. It belongs to a new class of EF-hand proteins, called PEF proteins, which contain five EF-hand motifs. At the N-terminus of grancalcin there is a approximately 50 residue-long segment rich in glycines and prolines. The fifth EF-hand, unpaired within the monomer, provides a means for dimerization through pairing with its counterpart in a second molecule. The structure of full-length grancalcin in the apo form and with one EF3 within the dimer occupied by a Ca(2+) ion have been determined. Although the N-terminal segment was present in the molecule, this part was disordered in the crystals. Here, the structure of a truncated form of grancalcin, which is lacking 52 N-terminal residues, in the presence and absence of Ca(2+) is presented. In the Ca(2+)-bound form the ions are found in the EF1 and EF3 hands. Binding of Ca(2+) to these two EF hands produces only minor conformational changes, mostly within the EF1 Ca(2+)-binding loop. This observation supports the hypothesis, formulated on the basis of the structure of a homologous protein ALG-2 which shows significant differences in the orientation of EF4 and EF5 compared with grancalcin, that calcium is a necessary factor but not sufficient alone for inducing a significant conformational change in PEF proteins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».