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Enregistrement W2100675461 · doi:10.2337/db08-1514

Genome-Wide Association Scan for Diabetic Nephropathy Susceptibility Genes in Type 1 Diabetes

2009· article· en· W2100675461 sur OpenAlexafffund
Marcus G. Pezzolesi, G. David Poznik, Josyf C. Mychaleckyj, Andrew D. Paterson, Michelle T. Barati, Jon B. Klein, Daniel P. K. Ng, Grzegorz Placha, Luís Henrique Santos Canani, Jacek Bocheński, Daryl Waggott, Michael L. Merchant, Bozena Krolewski, Lucia Mirea, Krzysztof Wanic, Pisut Katavetin, Masahiko Kure, Paweł Wołkow, Jonathon S. Dunn, Adam M. Smiles, William H. Walker, Andrew P. Boright, Shelley B. Bull, Alessandro Doria, John Rogus, Stephen S. Rich, James H. Warram, Andrzej S. Królewski

Notice bibliographique

RevueDiabetes · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Kidney Disease and Diabetes
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalUniversity Health NetworkUniversity of TorontoSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenPublic Health Ontario
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesCenters for Disease Control and PreventionU.S. Public Health ServiceCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthDivision of Diabetes, Endocrinology, and Metabolic DiseasesFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismDiabetic nephropathyGenome-wide association studyDiabetes mellitusNephropathyMedicineType 1 diabetesGenetic predispositionInternal medicineOdds ratioGeneticsBiologyEndocrinologyDiseaseGenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Despite extensive evidence for genetic susceptibility to diabetic nephropathy, the identification of susceptibility genes and their variants has had limited success. To search for genes that contribute to diabetic nephropathy, a genome-wide association scan was implemented on the Genetics of Kidneys in Diabetes collection. RESEARCH DESIGN AND METHODS: We genotyped approximately 360,000 single nucleotide polymorphisms (SNPs) in 820 case subjects (284 with proteinuria and 536 with end-stage renal disease) and 885 control subjects with type 1 diabetes. Confirmation of implicated SNPs was sought in 1,304 participants of the Diabetes Control and Complications Trial (DCCT)/Epidemiology of Diabetes Interventions and Complications (EDIC) study, a long-term, prospective investigation of the development of diabetes-associated complications. RESULTS: A total of 13 SNPs located in four genomic loci were associated with diabetic nephropathy with P < 1 x 10(-5). The strongest association was at the FRMD3 (4.1 protein ezrin, radixin, moesin [FERM] domain containing 3) locus (odds ratio [OR] = 1.45, P = 5.0 x 10(-7)). A strong association was also identified at the CARS (cysteinyl-tRNA synthetase) locus (OR = 1.36, P = 3.1 x 10(-6)). Associations between both loci and time to onset of diabetic nephropathy were supported in the DCCT/EDIC study (hazard ratio [HR] = 1.33, P = 0.02, and HR = 1.32, P = 0.01, respectively). We demonstratedexpression of both FRMD3 and CARS in human kidney. CONCLUSIONS: We identified genetic associations for susceptibility to diabetic nephropathy at two novel candidate loci near the FRMD3 and CARS genes. Their identification implicates previously unsuspected pathways in the pathogenesis of this important late complication of type 1 diabetes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations291
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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