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Enregistrement W2100693338 · doi:10.1158/1055-9965.epi-06-0566

Epistatic Relationship between the Cancer Susceptibility Genes <i>CHEK2</i> and <i>p27</i>

2007· article· en· W2100693338 sur OpenAlexaff
Cezary Cybulski, Bartłomiej Gliniewicz, A. Sikorski, Józef Kładny, Tomasz Huzarski, Jacek Gronwald, Tomasz Byrski, Tadeusz Dębniak, Bohdan Górski, Anna Jakubowska, Dominika Wokołorczyk, Steven A. Narod, Jan Lubiński

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensCoalition for Research in Women's HealthUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCHEK2Missense mutationGenotypeProstate cancerAlleleOdds ratioColorectal cancerGeneticsEpistasisCancerOncologyBiologyGeneInternal medicineCancer researchMedicineMutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We studied the effects of p27 and CHEK2 variants on prostate and colon cancer risk in a case-control study. Modest effects on prostate cancer risk were observed for both CHEK2 missense and truncating variants. However, the excess cancer risk was restricted to the subgroup of men who were homozygous for the VV genotype in codon 109 of the p27 gene. Among men with the VV p27 genotype, the odds ratios associated with truncating and missense CHEK2 mutations were 3.1 (P < 0.0001) and 1.9 (P < 0.0001), respectively. Among men with other p27 genotypes (GG and VG), the odds ratios were 1.5 and 1.2 for truncating and missense CHEK2 mutations, respectively, and were not statistically significant. The interaction between CHEK2 and p27 was confirmed in a group of patients with colon cancer. Thus, it seems that the clinical expression of CHEK2 variant alleles on prostate and colon cancer risk may be restricted to individuals with a specific genotype (VV) of the p27 gene. Two-gene models provide numerous challenges for gene identification and cancer risk assessment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,389
Écart entre enseignants0,322 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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