Epistatic Relationship between the Cancer Susceptibility Genes <i>CHEK2</i> and <i>p27</i>
Notice bibliographique
Résumé
We studied the effects of p27 and CHEK2 variants on prostate and colon cancer risk in a case-control study. Modest effects on prostate cancer risk were observed for both CHEK2 missense and truncating variants. However, the excess cancer risk was restricted to the subgroup of men who were homozygous for the VV genotype in codon 109 of the p27 gene. Among men with the VV p27 genotype, the odds ratios associated with truncating and missense CHEK2 mutations were 3.1 (P < 0.0001) and 1.9 (P < 0.0001), respectively. Among men with other p27 genotypes (GG and VG), the odds ratios were 1.5 and 1.2 for truncating and missense CHEK2 mutations, respectively, and were not statistically significant. The interaction between CHEK2 and p27 was confirmed in a group of patients with colon cancer. Thus, it seems that the clinical expression of CHEK2 variant alleles on prostate and colon cancer risk may be restricted to individuals with a specific genotype (VV) of the p27 gene. Two-gene models provide numerous challenges for gene identification and cancer risk assessment.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».