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Enregistrement W2100722163 · doi:10.3109/13693786.2013.813086

Isolation, expression and characterization of a minor allergen from<i>Penicillium crustosum</i>

2013· article· en· W2100722163 sur OpenAlexaff
M. Serdal Sevinc, Veena Kumar, Makonnen Abebe, Michèle Lemieux, Hari M. Vijay

Notice bibliographique

RevueMedical Mycology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAllergic Rhinitis and Sensitization
Établissements canadiensHealth Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAllergenPenicilliumEscherichia coliBiologyMolecular biologyEpitopeComplementary DNAPeptide sequenceMicrobiologyChemistryAntibodyBiochemistryAllergyGeneticsImmunologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A ribosomal P1 protein, Pen b 26 from Penicillium brevicompactum, was previously identified as a major allergen. A homolog protein was isolated and characterized from Penicillium crustosum which is not known to be allergenic mold. A cDNA library of P. crustosum was constructed and screened using a probe based on the DNA sequence of Pen b 26. A positive clone was isolated, expressed in Escherichia coli, purified and characterized by comparing its immunological and physical properties to Pen b 26. It was designated as Pen cr 26 and had a 321 nt ORF corresponding to 107 amino acids with a MW of 11 kDa. Pen cr 26 had strong sequence homology to Pen b 26 (92% for nucleotides and 86% for amino acids) and its physical and predicted structural properties were similar to the latter. The level of expression of Pen cr 26 was much lower than that of Pen b 26 in the same expression vector. Both proteins were recognized equally well by the IgG class specific antibodies, but Pen cr 26 was poorly recognized by Penicillium-sensitive atopic sera (IgE), suggesting striking antigenic difference in IgE epitopes, i.e., 87% were positive for Pen b 26 while only 23% were positive for Pen cr 26. The allergenicity of Pen cr 26 seems to be minor in nature and it could be a hypoallergenic variant of Pen b 26.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,953
Score d'incertitude au seuil0,994

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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