Changes in chromatin structure and mobility in living cells at sites of DNA double-strand breaks
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
The repair of DNA double-strand breaks (DSBs) is facilitated by the phosphorylation of H2AX, which organizes DNA damage signaling and chromatin remodeling complexes in the vicinity of the lesion (Pilch, D.R., O.A. Sedelnikova, C. Redon, A. Celeste, A. Nussenzweig, and W.M. Bonner. 2003. Biochem. Cell Biol. 81:123–129; Morrison, A.J., and X. Shen. 2005. Cell Cycle. 4:568–571; van Attikum, H., and S.M. Gasser. 2005. Nat. Rev. Mol. Cell. Biol. 6:757–765). The disruption of DNA integrity induces an alteration of chromatin architecture that has been proposed to activate the DNA damage transducing kinase ataxia telangiectasia mutated (ATM; Bakkenist, C.J., and M.B. Kastan. 2003. Nature. 421:499–506). However, little is known about the physical properties of damaged chromatin. In this study, we use a photoactivatable version of GFP-tagged histone H2B to examine the mobility and structure of chromatin containing DSBs in living cells. We find that chromatin containing DSBs exhibits limited mobility but undergoes an energy-dependent local expansion immediately after DNA damage. The localized expansion observed in real time corresponds to a 30–40% reduction in the density of chromatin fibers in the vicinity of DSBs, as measured by energy-filtering transmission electron microscopy. The observed opening of chromatin occurs independently of H2AX and ATM. We propose that localized adenosine triphosphate–dependent decondensation of chromatin at DSBs establishes an accessible subnuclear environment that facilitates DNA damage signaling and repair.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle