Common Polymorphisms in the Promoter of the Visfatin Gene (<i>PBEF1</i>) Influence Plasma Insulin Levels in a French-Canadian Population
Notice bibliographique
Résumé
The adipokine visfatin (PBEF1) exhibits insulin-mimetic effects and correlates strongly with visceral adiposity. We sequenced visfatin gene exons and 1,480 bp of the promoter in 23 individuals, including 18 individuals from the Quebec Family Study (QFS) with varying degrees of abdominal visceral fat, assessed by computed tomography, and 5 individuals from the Saguenay-Lac-Saint-Jean region of Québec. We identified a synonymous polymorphism in exon 7 (SER301SER) but no nonsynonymous mutations. We observed an additional 10 polymorphisms, including 5 intronic, 4 within the promoter, and 1 within the 3' untranslated region. Further promoter sequencing (816 bp) identified five additional single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the QFS population. To investigate the role of visfatin gene variants in obesity-related phenotypes, we genotyped a total of 13 SNPs in the promoter region of the gene. From these, we analyzed the seven common SNPs in the QFS sample (918 participants from 208 families). A significant association was found between two SNPs (rs9770242 and rs1319501), in perfect linkage disequilibrium, and fasting insulin levels (P = 0.002). These SNPs were also associated with fasting glucose (P <or= 0.02). In addition, a more distal SNP (rs7789066) was significantly associated with the apolipoprotein B component of VLDL (P = 0.012).
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».