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Enregistrement W2100795480 · doi:10.1111/fwb.12279

Incorporating continuous trait variation into biomonitoring assessments by measuring and assigning trait values to individuals or taxa

2013· article· en· W2100795480 sur OpenAlexaff
Jessica M. Orlofske, Donald J. Baird

Notice bibliographique

RevueFreshwater Biology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueFreshwater macroinvertebrate diversity and ecology
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesU.S. Environmental Protection Agency
Mots-clésTraitBiomonitoringTaxonBiologyAquatic insectEcologyConcordanceTaxonomic rankInvertebrateQuantitative trait locusZoologyHabitatGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Traits‐based analyses of insect assemblages support biomonitoring programme objectives. To date, however, few traits‐based metrics have demonstrated the degree of sensitivity or discriminatory power required by biomonitoring programmes. Trait information used for analyses is typically based on static descriptions of dynamic communities and is attributed only to taxonomic units. Given that traits can vary even among specimens from the same species, quantifying trait variation and its consequences could be essential for successful traits‐based biomonitoring. Here, we study the consequences of measuring trait expression among individual specimens versus assigning trait states from published databases at the taxon level (genus or family) for the interpretation of trait patterns within aquatic insect assemblages. Specifically, do database body size trait states accurately reflect measured body size values of aquatic insects collected in biomonitoring samples and should body size data be aggregated at the taxon level or assessed at the specimen level to detect differences among sites? We assessed body size, a continuous trait linked to fundamental organism properties and ecological function, for four orders of aquatic insects: Ephemeroptera, Plecoptera, Trichoptera and Odonata. Invertebrate samples were collected from the Miramichi River basin (New Brunswick, Canada) according to the Canadian Aquatic Biomonitoring Network method. Concordance between measured specimen sizes and published trait states was poor; 55% of taxa expressed body sizes considerably smaller or larger than assigned database states. Recalibration of size classes based on specimen measurements yielded three size classes that facilitated detection of assemblage‐aggregated size differences among reference sites. Measured body size trait values were able to distinguish these differences in community structure, while values derived from databases yielded erroneous patterns in the size structure among sites. Gaining accurate ecological insights from traits‐based biomonitoring may require assessing trait properties at the scale of individual specimens. The benefits of this approach, however, should be balanced against additional effort required in the context of specific study or programme objectives.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,029

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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