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Enregistrement W2100927775 · doi:10.1158/1541-7786.mcr-07-2175

Sox7 Is an Independent Checkpoint for β-Catenin Function in Prostate and Colon Epithelial Cells

2008· article· en· W2100927775 sur OpenAlexaff
Lizheng Guo, Diansheng Zhong, Stephen K. Lau, Xiuju Liu, Xue–Yuan Dong, Xiaodong Sun, Vincent W. Yang, Paula M. Vertino, Carlos S. Moreno, Vijay Varma, Jin‐Tang Dong, Wei Zhou

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer Research · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensImmunovaccine (Canada)
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésCancer researchEctopic expressionBiologyWnt signaling pathwayCateninGene silencingProstate cancerProstateAdenomatous polyposis coliChromoplexyEpigeneticsColorectal cancerCancerCell cultureGenePCA3Genetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The presence of somatic beta-catenin mutations in some prostate cancers implies that aberrant WNT signaling is involved in the cancer development. Although beta-catenin stability is regulated by a multicomponent destruction complex, mutational alterations of beta-catenin or other components of the destruction complexes are rare in prostate tumors. Therefore, beta-catenin may be regulated by another protein in the prostate. In fact, recent linkage and somatic deletion analyses in prostate cancers reveal a 1.4-Mb candidate tumor suppressor locus on 8p23.1, which includes the Sox7 gene. Here we show that Sox7 protein expression was indeed down-regulated in 47% (15 of 32) of prostate adenocarcinomas. In addition, Sox7 mRNA was down-regulated in 60% of snap-frozen tumors. This down-regulation was found to be due to tumor-specific promoter hypermethylation, which was present in 48% (10 of 21) of primary prostate tumors and 44% (11 of 25) of prostate cancer cell lines/xenografts. We discovered that Sox7 protein physically interacts with beta-catenin and suppresses beta-catenin-mediated transcription by depleting active beta-catenin. Furthermore, in HCT116 colorectal cancer cell lines with Sox7 inactivation, ectopic Sox7 expression suppressed cell proliferation and inhibited transcription that was activated by an endogenous mutant beta-catenin. Although nearly all colorectal cancers contain mutations in beta-catenin or adenomatous polyposis coli/axin, epigenetic silencing of Sox7 was still observed. These data suggest that Sox7 is a tumor suppressor that functions as an independent checkpoint for beta-catenin transcriptional activity. Inactivation of Sox7 could promote the development of a majority of colorectal tumors and approximately half of prostate tumors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations89
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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