Genetic Variation of the Bloom-Forming Cyanobacterium<i>Microcystis aeruginosa</i>within and among Lakes: Implications for Harmful Algal Blooms
Notice bibliographique
Résumé
To measure genetic variation within and among populations of the bloom-forming cyanobacterium Microcystis aeruginosa, we surveyed a suite of lakes in the southern peninsula of Michigan that vary in productivity (total phosphorus concentrations of approximately 10 to 100 microg liter(-1)). Survival of M. aeruginosa isolates from lakes was relatively low (i.e., mean of 7% and maximum of 30%) and positively related to lake total phosphorus concentration (P = 0.014, r2 = 0.407, n = 14). In another study (D. F. Raikow, O. Sarnelle, A. E. Wilson, and S. K. Hamilton, Limnol. Oceanogr. 49:482-487, 2004), survival rates of M. aeruginosa isolates collected from an oligotrophic lake (total phosphorus of approximately 10 mug liter(-1) and dissolved inorganic nitrogen:total phosphorus ratio of 12.75) differed among five different medium types (G test, P of <0.001), with higher survival (P = 0.003) in low-nutrient media (28 to 37% survival) than in high-nutrient media. Even with the relatively low isolate survivorship that could select against detecting the full range of genetic variation, populations of M. aeruginosa were genetically diverse within and among lakes (by analysis of molecular variance, Phi(sc) = 0.412 [Phi(sc) is an F-statistic derivative which evaluates the correlation of haplotypic diversity within populations relative to the haplotypic diversity among all sampled populations], P = 0.001), with most clones being distantly related to clones collected from lakes directly attached to Lake Michigan (a Laurentian Great Lake) and culture collection strains collected from Canada, Scotland, and South Africa. Ninety-one percent of the 53 genetically unique M. aeruginosa clones contained the microcystin toxin gene (mcyA). Genotypes with the toxin gene were found in all lakes, while four lakes harbored both genotypes possessing and genotypes lacking the toxin gene.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».